Transmission pathways and genogroup contribution in Stenotrophomonas maltophilia dissemination: experience from a French university hospital

C. Sakr*, M. Danjean, M. Darty-Mercier, F. Cizeau, D. Ducellier, F. Fourreau, S. Romano-Bertrand, G. Royer, P-L. Woerther, J-W. Decousser
*University Hospital Henri Mondor, Assistance Publique—Hôpitaux de Paris, France

Journal of Hospital Infection (2026) 168, 134-143

背景

ステノトロホモナス・マルトフィリア（Stenotrophomonas maltophilia）は、免疫不全の患者に感染する環境日和見病原体である。そのゲノムが不均一であることから、S. maltophilia 複合体が定義された。この複合体には、拡散能力が不明の様々な亜集団（遺伝子群）が含まれている。この研究は、病院の環境における S. maltophilia の疫学および遺伝子群の寄与を、網羅的な全ゲノムシークエンシング（WGS）の手法を使って明らかにすることを目的とした。

方法

前向きの 16 か月間の研究を 900 床の大学病院で実施した。臨床および環境検体からの合計で 204 株が WGS の対象となった。株の間の関連性を疫学データに従って明らかにするために、コアゲノム複数部位塩基配列タイピングを実施した。クラスターを形成した株の間での対立遺伝子変異を解析した。遺伝子群を WGS から同定し、遺伝子群の相対的寄与をクラスターを形成した株とクラスターを形成しなかった株の間で特定した。

結果

ヒト（N ＝ 156）および環境（N ＝ 33）由来の重複のない 189 個のゲノムで、24 個のクラスター（55 株、クラスター当たり 2 から 6 株）が特定された。環境が 4 個、ヒトが 16 個、混合が 4 個であった。時間的および／または地理的な重なりが、24 個のクラスターのうち 22 個で特定された。ヒトに適応したと考えられる主な遺伝子群、例えば、遺伝子群 6 は、ヒトの株の間では優勢であったが、クラスターを形成した株において大きな比率を占めることはなかった。クラスターを形成した株において、最多で 6 個の対立遺伝子変異が特定された。6 個の遺伝子が複数の対立遺伝子変異に関与していた。

結論

S. maltophilia が交差伝播する可能性は低いと考えられているが、この長期的な研究では、患者から患者へと推定される交差伝播イベントがいくつかはっきりと示された。しかし、特定の遺伝子群が大きな比率を占めることはなかった。更に規模の大きい研究の結果が出るまでは、これらの結果が、リスクの高い状況において、S. maltophilia の保菌者の周りの感染制御を強化することを支持している。

サマリー原文（英語）はこちら

監訳者コメント ：

S. maltophilia はカルバペネム系抗菌薬に自然耐性菌であるが、標準予防策で対応している医療機関が多い。本研究では、ゲノム解析により交差感染が明らかになり、状況に応じて感染対策強化の必要性が示唆された。

Assessing cross-transmission of Gram-negative bacteria in the intensive care unit: a prospective comparison of IR-Biotyper and core-genome multi-locus sequence typing

A. Villa*, M. Danjean, C. Sakr, F. Cizeau, D. Ducellier, M. N’Debi, A. Mekontso-Dessap, K. Razazi, J-W. Decousser
*Hôpitaux Universitaires Henri Mondor, France

Journal of Hospital Infection (2026) 170, 92-99

The Omicron variant significantly increases viral load emissions in healthcare settings: implication for healthcare workers

F. Rossi*, K-P. Pelletier, M. Veillette, B. Paquet-Bolduc, C. Duchaine
*Université Laval (CRIUCPQ-UL), Canada

Journal of Hospital Infection (2025) 163, 88-97

Nurse-led design and evaluation of a retractable safety needle for injection safety

C.W. Liu*, M. Koo, Z.C. Lin
*Mennonite Christian Hospital, Taiwan

Journal of Hospital Infection (2025) 164, 96-104

Identifying and quantifying ESKAPEE pathogens in and around sinks in high burden hospitals

L.B. Saber*, M. Rojas, I.C. Blakley, S. Sun, M.E.J. Lott, A.A. Fodor, C.C. Toledo, J. Brown
*University of North Carolina at Chapel Hill, USA

Journal of Hospital Infection (2026) 174, 77-86

Diagnostic stewardship programme for urine culture: impact on antimicrobial prescription in a multi-centre cohort

A.L.H. Lee^*, E.C.M. Leung, M.K.P. Lee, R.W.M. Lai
^*Prince of Wales Hospital, Hong Kong

Journal of Hospital Infection (2021) 108, 81-89