Surveillance of multi-drug resistance phenotypes in Staphylococcus aureus in Japan and correlation with whole-genome sequence findings

Y. Hosaka*, K. Yahara, A. Clark, H. Kitagawa, J. Hisatsune, M. Sugai, K. Shibayama, J. Stelling
*National Institute of Infectious Diseases, Japan

Journal of Hospital Infection (2022) 123, 34-42

背景

黄色ブドウ球菌（Staphylococcus aureus）の抗菌薬耐性は、大きな疾病負荷をかける。表現型および遺伝子型の両方のモニタリングは、新興耐性菌株の理解と封じ込めの鍵である。

目的

黄色ブドウ球菌の新たに出現した耐性の表現型のモニタリングと、重要度の高い菌株の表現型と全ゲノムシークエンシング（WGS）の結果との相関性。

方法

2011 年から 2019 年までの、213 の参加病院の 40,000 超の分離株の抗菌薬感受性試験の結果を、院内感染対策サーベイランス（JANIS）の全国的なデータベースからエクスポートした。黄色ブドウ球菌の特徴的な多剤耐性の表現型（耐性プロファイル）の長期的・地理的な分布と有病率は、病院および県の間で検討した。さらに、懸念すべき特定の耐性プロファイルを有する菌株のゲノムシークエンス解析を実施した。

結果

メチシリン耐性黄色ブドウ球菌（MRSA）の全体の有病率は、2011 年の 40.3％から 2019 年には 35.1％に低下した。しかし、9 年間で、黄色ブドウ球菌の多数の耐性プロファイルのうち、MRSA の 型の1 つのプロファイルのみが、入院患者の頻度において 10％を超える統計学的に有意な増加を示した。この MRSA のプロファイルは、オキサシリン、エリスロマイシンおよびレボフロキサシンに耐性を示した。この表現型を有する黄色ブドウ球菌分離株の WGS の結果の解析によって、ほとんどは clonal complex 8 に属しており、すべてが市中獲得型 MRSA に特有の SCCmec IV を保有することが明らかになった。

結論

特徴的な耐性プロファイルの追跡によって、MRSA の全体的な減少への理解が深まり、新たな耐性表現型の出現を認識することにつながった。本研究では、多剤耐性表現型と相関する抗菌薬耐性に関する選択的なゲノムシークエンシングを用いた今後の疫学的研究モデルを提供しており、これは他の細菌種に適用できる可能性がある。

サマリー原文（英語）はこちら

監訳者コメント：

日本の MRSA の分離頻度の推移と分子疫学に関する研究。MRSA の分離率は低下したが、いわゆる CA-MRSA は増加した。経時的な増減だけでなく、薬剤感受性の推移や、MLST にも触れている。日本の MRSA の疫学について深掘りしたい人には必須の論文。

Detection of influenza virus in air samples of patient rooms
 

A. Chamseddine^*, N. Soudani, Z. Kanafani, I. Alameddine, G. Dbaibo, H. Zaraket, M. El-Fadel
^*American University of Beirut, Lebanon
 

Journal of Hospital Infection (2021) 108, 33-42
 
 

Investigation and control of an outbreak due to a contaminated hospital water system, identified following a rare case of Cupriavidus pauculus bacteraemia

T. Inkster*, C. Peters, T. Wafer, D. Holloway, T. Makin

*Queen Elizabeth University Hospital, UK

Journal of Hospital Infection (2021) 111, 53-64

Impact of supplementary air filtration on aerosols and particulate matter in a UK hospital ward: a case study

M.J. Butler*, D. Sloof, C. Peters, A. Conway Morris, T. Gouliouris, R. Thaxter, V.L. Keevil, C.B. Beggs
*Cambridge University Hospitals, UK

Journal of Hospital Infection (2023) 135, 81-89

Usability and outcomes of self-monitored surgical wound healing using a smartphone-based application by patients following neurosurgery

C. van Rossum*, K. de Bree, G. de Jong, R. Bartels, G. Heeren, M. Nabuurs, C. Meijer, A. Tostmann, R. Aquarius
*Radboud University Medical Centre, The Netherlands

Journal of Hospital Infection (2024) 148, 138-144

Patient engagement to counter catheter-associated urinary tract infections with an app (PECCA): a multicentre, prospective, interrupted time-series and before-and-after study

R.G. Bentvelsen*, B.J. Laan, T. Bonten, R. van der Vaart, D.J. Hetem, R. Soetekouw, S.E. Geerlings, N.H. Chavannes, K.E. Veldkamp
*Leiden University Medical Centre, The Netherlands

Journal of Hospital Infection (2024) 147, 98-106