日本の黄色ブドウ球菌(Staphylococcus aureus)の多剤耐性表現型のサーベイランスと全ゲノムシークエンスの結果との相関性★
Surveillance of multi-drug resistance phenotypes in Staphylococcus aureus in Japan and correlation with whole-genome sequence findings Y. Hosaka*, K. Yahara, A. Clark, H. Kitagawa, J. Hisatsune, M. Sugai, K. Shibayama, J. Stelling *National Institute of Infectious Diseases, Japan Journal of Hospital Infection (2022) 123, 34-42
背景
黄色ブドウ球菌(Staphylococcus aureus)の抗菌薬耐性は、大きな疾病負荷をかける。表現型および遺伝子型の両方のモニタリングは、新興耐性菌株の理解と封じ込めの鍵である。
目的
黄色ブドウ球菌の新たに出現した耐性の表現型のモニタリングと、重要度の高い菌株の表現型と全ゲノムシークエンシング(WGS)の結果との相関性。
方法
2011 年から 2019 年までの、213 の参加病院の 40,000 超の分離株の抗菌薬感受性試験の結果を、院内感染対策サーベイランス(JANIS)の全国的なデータベースからエクスポートした。黄色ブドウ球菌の特徴的な多剤耐性の表現型(耐性プロファイル)の長期的・地理的な分布と有病率は、病院および県の間で検討した。さらに、懸念すべき特定の耐性プロファイルを有する菌株のゲノムシークエンス解析を実施した。
結果
メチシリン耐性黄色ブドウ球菌(MRSA)の全体の有病率は、2011 年の 40.3%から 2019 年には 35.1%に低下した。しかし、9 年間で、黄色ブドウ球菌の多数の耐性プロファイルのうち、MRSA の 型の1 つのプロファイルのみが、入院患者の頻度において 10%を超える統計学的に有意な増加を示した。この MRSA のプロファイルは、オキサシリン、エリスロマイシンおよびレボフロキサシンに耐性を示した。この表現型を有する黄色ブドウ球菌分離株の WGS の結果の解析によって、ほとんどは clonal complex 8 に属しており、すべてが市中獲得型 MRSA に特有の SCCmec IV を保有することが明らかになった。
結論
特徴的な耐性プロファイルの追跡によって、MRSA の全体的な減少への理解が深まり、新たな耐性表現型の出現を認識することにつながった。本研究では、多剤耐性表現型と相関する抗菌薬耐性に関する選択的なゲノムシークエンシングを用いた今後の疫学的研究モデルを提供しており、これは他の細菌種に適用できる可能性がある。
監訳者コメント:
日本の MRSA の分離頻度の推移と分子疫学に関する研究。MRSA の分離率は低下したが、いわゆる CA-MRSA は増加した。経時的な増減だけでなく、薬剤感受性の推移や、MLST にも触れている。日本の MRSA の疫学について深掘りしたい人には必須の論文。
同カテゴリの記事
Use of a peracetic acid (PAA) disinfectant to reduce total viable bacteria count in hospital wastewater drains K. Sharrocks*, D. Prossomariti, L.B. Snell, M. Dibbens, A. Alcolea-Medina, L. Gargee, J. Marashi, J.D. Edgeworth, J.A. Otter, S.D. Goldenberg *Cambridge University Hospitals NHS Foundation Trust, Cambridge, UK Journal of Hospital Infection (2024) 151, 79-83
Effectiveness of portable air filtration on reducing indoor aerosol transmission: preclinical observational trials J.H. Lee*, M. Rounds, F. McGain, R. Schofield, G. Skidmore, I. Wadlow, K. Kevin, A. Stevens, C. Marshall, L. Irving, M. Kainer, K. Buising, J. Monty *University of Melbourne, Australia Journal of Hospital Infection (2022) 119, 163-169
Burden of surgical management of prosthetic joint infections following hip and knee replacements in Alberta, Canada: an analysis and comparison of two major urban centres K. Mponponsuo*, J. Leal, S. Puloski, D. Chew, S. Chavda, A. Ismail, F.Au, E. Rennert-May *University of Calgary, Canada Journal of Hospital Infection (2024) 150, 153-162
The effect of an intervention bundle to prevent central venous catheter-related bloodstream infection in a national programme in the Netherlands T.I.I. van der Kooi*, E.A. Smid, M.B.G. Koek, S.E. Geerlings, L.G.M. Bode, T.E.M. Hopmans, S.C. de Greeff *National Institute for Public Health and the Environment, the Netherlands Journal of Hospital Infection (2023) 131, 194-202
The relative efficacy of multiple syringe tip disinfection techniques against virulent staphylococcus contamination S. Gibbons*, F. Dexter, R.W. Loftus, J.R. Brown, B.T. Wanta, J.E. Charnin *University of Iowa, USA Journal of Hospital Infection (2024) 145, 142-147
