日本の黄色ブドウ球菌(Staphylococcus aureus)の多剤耐性表現型のサーベイランスと全ゲノムシークエンスの結果との相関性★
Surveillance of multi-drug resistance phenotypes in Staphylococcus aureus in Japan and correlation with whole-genome sequence findings Y. Hosaka*, K. Yahara, A. Clark, H. Kitagawa, J. Hisatsune, M. Sugai, K. Shibayama, J. Stelling *National Institute of Infectious Diseases, Japan Journal of Hospital Infection (2022) 123, 34-42
背景
黄色ブドウ球菌(Staphylococcus aureus)の抗菌薬耐性は、大きな疾病負荷をかける。表現型および遺伝子型の両方のモニタリングは、新興耐性菌株の理解と封じ込めの鍵である。
目的
黄色ブドウ球菌の新たに出現した耐性の表現型のモニタリングと、重要度の高い菌株の表現型と全ゲノムシークエンシング(WGS)の結果との相関性。
方法
2011 年から 2019 年までの、213 の参加病院の 40,000 超の分離株の抗菌薬感受性試験の結果を、院内感染対策サーベイランス(JANIS)の全国的なデータベースからエクスポートした。黄色ブドウ球菌の特徴的な多剤耐性の表現型(耐性プロファイル)の長期的・地理的な分布と有病率は、病院および県の間で検討した。さらに、懸念すべき特定の耐性プロファイルを有する菌株のゲノムシークエンス解析を実施した。
結果
メチシリン耐性黄色ブドウ球菌(MRSA)の全体の有病率は、2011 年の 40.3%から 2019 年には 35.1%に低下した。しかし、9 年間で、黄色ブドウ球菌の多数の耐性プロファイルのうち、MRSA の 型の1 つのプロファイルのみが、入院患者の頻度において 10%を超える統計学的に有意な増加を示した。この MRSA のプロファイルは、オキサシリン、エリスロマイシンおよびレボフロキサシンに耐性を示した。この表現型を有する黄色ブドウ球菌分離株の WGS の結果の解析によって、ほとんどは clonal complex 8 に属しており、すべてが市中獲得型 MRSA に特有の SCCmec IV を保有することが明らかになった。
結論
特徴的な耐性プロファイルの追跡によって、MRSA の全体的な減少への理解が深まり、新たな耐性表現型の出現を認識することにつながった。本研究では、多剤耐性表現型と相関する抗菌薬耐性に関する選択的なゲノムシークエンシングを用いた今後の疫学的研究モデルを提供しており、これは他の細菌種に適用できる可能性がある。
監訳者コメント:
日本の MRSA の分離頻度の推移と分子疫学に関する研究。MRSA の分離率は低下したが、いわゆる CA-MRSA は増加した。経時的な増減だけでなく、薬剤感受性の推移や、MLST にも触れている。日本の MRSA の疫学について深掘りしたい人には必須の論文。
同カテゴリの記事
Modifiable risk factors associated with later gut decolonization of carbapenem-resistant Gram-negative bacteria in children: a prospective cohort study V.-M. Darda*, E. Iosifidis, C. Antachopoulos, F. Kirvasilis, C. Zarras, A.B. Haidich, E. Papakonstantinou, A. Kontou, M. Sdougka, E. Roilides *Aristotle University of Thessaloniki, and Hippokration General Hospital, Greece Journal of Hospital Infection (2023) 136, 75-84
Survey of current national and international guidance to reduce risk of aspergillosis in hospitals S. Bamber*, D. Haiduven, D.W. Denning *The University of Manchester and Manchester Academic Health Science Centre, UK Journal of Hospital Infection (2025) 159, 124-139
Risk factors for hospital-acquired infection during the SARS-CoV-2 pandemic J.H. Kwon*, K.B. Nickel, K.A. Reske, D. Stwalley, E.R. Dubberke, P.G. Lyons, A. Michelson, K. McMullen, J.M. Sahrmann, S. Gandra, M.A. Olsen, J.P. Burnham *Washington University in St Louis School of Medicine, USA Journal of Hospital Infection (2023) 133, 8-14
Strategies to improve the implementation of infection control link nurse programmes in acute-care hospitals M. Dekker*, I.P. Jongerden, M.C. de Bruijne, J.G.M. Jelsma, C.M.J.E. Vandenbroucke-Grauls, R. van Mansfeld *Vrije Universiteit Amsterdam, The Netherlands Journal of Hospital Infection (2022) 128, 54-63
How clean is your ice machine? Revealing microbial amplification and presence of opportunistic pathogens in hospital ice-water machines M. Cazals*, E. Bédard, C. Soucy, P. Savard, M. Prévost *Polytechnique Montréal, Canada Journal of Hospital Infection (2023) 141, 9-16
