日本の黄色ブドウ球菌(Staphylococcus aureus)の多剤耐性表現型のサーベイランスと全ゲノムシークエンスの結果との相関性★
Surveillance of multi-drug resistance phenotypes in Staphylococcus aureus in Japan and correlation with whole-genome sequence findings Y. Hosaka*, K. Yahara, A. Clark, H. Kitagawa, J. Hisatsune, M. Sugai, K. Shibayama, J. Stelling *National Institute of Infectious Diseases, Japan Journal of Hospital Infection (2022) 123, 34-42
背景
黄色ブドウ球菌(Staphylococcus aureus)の抗菌薬耐性は、大きな疾病負荷をかける。表現型および遺伝子型の両方のモニタリングは、新興耐性菌株の理解と封じ込めの鍵である。
目的
黄色ブドウ球菌の新たに出現した耐性の表現型のモニタリングと、重要度の高い菌株の表現型と全ゲノムシークエンシング(WGS)の結果との相関性。
方法
2011 年から 2019 年までの、213 の参加病院の 40,000 超の分離株の抗菌薬感受性試験の結果を、院内感染対策サーベイランス(JANIS)の全国的なデータベースからエクスポートした。黄色ブドウ球菌の特徴的な多剤耐性の表現型(耐性プロファイル)の長期的・地理的な分布と有病率は、病院および県の間で検討した。さらに、懸念すべき特定の耐性プロファイルを有する菌株のゲノムシークエンス解析を実施した。
結果
メチシリン耐性黄色ブドウ球菌(MRSA)の全体の有病率は、2011 年の 40.3%から 2019 年には 35.1%に低下した。しかし、9 年間で、黄色ブドウ球菌の多数の耐性プロファイルのうち、MRSA の 型の1 つのプロファイルのみが、入院患者の頻度において 10%を超える統計学的に有意な増加を示した。この MRSA のプロファイルは、オキサシリン、エリスロマイシンおよびレボフロキサシンに耐性を示した。この表現型を有する黄色ブドウ球菌分離株の WGS の結果の解析によって、ほとんどは clonal complex 8 に属しており、すべてが市中獲得型 MRSA に特有の SCCmec IV を保有することが明らかになった。
結論
特徴的な耐性プロファイルの追跡によって、MRSA の全体的な減少への理解が深まり、新たな耐性表現型の出現を認識することにつながった。本研究では、多剤耐性表現型と相関する抗菌薬耐性に関する選択的なゲノムシークエンシングを用いた今後の疫学的研究モデルを提供しており、これは他の細菌種に適用できる可能性がある。
監訳者コメント:
日本の MRSA の分離頻度の推移と分子疫学に関する研究。MRSA の分離率は低下したが、いわゆる CA-MRSA は増加した。経時的な増減だけでなく、薬剤感受性の推移や、MLST にも触れている。日本の MRSA の疫学について深掘りしたい人には必須の論文。
同カテゴリの記事
Establishment and application of test methodology demonstrating the functionality of air purification systems in reducing virus-loaded aerosol in indoor air J.M.B.M. van der Vossen*, A.P. Kreikamp, V. Hatt, A.M.T. Ouwens, D.J. Brasem, M. Heerikhuisen, R.C. Montijn *The Netherlands Organisation for Applied Scientific Research TNO, the Netherlands Journal of Hospital Infection (2023) 135, 74-80
Point prevalence survey of antibiotic use and healthcare-associated infections in acute care hospitals: a comprehensive report from the Marche Region of Italy P. Barbadoro*, J. Dolcini, C. Fortunato, D. Mengarelli detto Rinaldini, E. Martini, M.G. Gioia, D. Mengoni, M.M. D’Errico, The Marche’s ICA-Net Working Collaborative Group *Polytechnic University of the Marche Region, Italy Journal of Hospital Infection (2023) 141, 80-87
Assessing the effects of transient weather conditions on airborne transmission risk in naturally ventilated hospitals A.J. Edwards*, M-F. King, M. López-García, D. Peckham, C.J. Noakes *University of Leeds, UK Journal of Hospital Infection (2024) 148, 1-10
Community-onset healthcare-associated MRSA bacteraemia in a district general hospital
Whole-genome sequencing reveals two prolonged simultaneous outbreaks involving Pseudomonas aeruginosa high-risk strains ST111 and ST235 with resistance to quaternary ammonium compounds A. Rath*, B. Kieninger, J. Fritsch, A. Caplunik-Pratsch, S. Blaas, M. Ochmann, M. Pfeifer, J. Hartle, T. Holzmann, W. Schneider-Brachert *University Hospital Regensburg, Germany Journal of Hospital Infection (2024) 145, 155-164
