Surveillance of multi-drug resistance phenotypes in Staphylococcus aureus in Japan and correlation with whole-genome sequence findings

Y. Hosaka*, K. Yahara, A. Clark, H. Kitagawa, J. Hisatsune, M. Sugai, K. Shibayama, J. Stelling
*National Institute of Infectious Diseases, Japan

Journal of Hospital Infection (2022) 123, 34-42

背景

黄色ブドウ球菌（Staphylococcus aureus）の抗菌薬耐性は、大きな疾病負荷をかける。表現型および遺伝子型の両方のモニタリングは、新興耐性菌株の理解と封じ込めの鍵である。

目的

黄色ブドウ球菌の新たに出現した耐性の表現型のモニタリングと、重要度の高い菌株の表現型と全ゲノムシークエンシング（WGS）の結果との相関性。

方法

2011 年から 2019 年までの、213 の参加病院の 40,000 超の分離株の抗菌薬感受性試験の結果を、院内感染対策サーベイランス（JANIS）の全国的なデータベースからエクスポートした。黄色ブドウ球菌の特徴的な多剤耐性の表現型（耐性プロファイル）の長期的・地理的な分布と有病率は、病院および県の間で検討した。さらに、懸念すべき特定の耐性プロファイルを有する菌株のゲノムシークエンス解析を実施した。

結果

メチシリン耐性黄色ブドウ球菌（MRSA）の全体の有病率は、2011 年の 40.3％から 2019 年には 35.1％に低下した。しかし、9 年間で、黄色ブドウ球菌の多数の耐性プロファイルのうち、MRSA の 型の1 つのプロファイルのみが、入院患者の頻度において 10％を超える統計学的に有意な増加を示した。この MRSA のプロファイルは、オキサシリン、エリスロマイシンおよびレボフロキサシンに耐性を示した。この表現型を有する黄色ブドウ球菌分離株の WGS の結果の解析によって、ほとんどは clonal complex 8 に属しており、すべてが市中獲得型 MRSA に特有の SCCmec IV を保有することが明らかになった。

結論

特徴的な耐性プロファイルの追跡によって、MRSA の全体的な減少への理解が深まり、新たな耐性表現型の出現を認識することにつながった。本研究では、多剤耐性表現型と相関する抗菌薬耐性に関する選択的なゲノムシークエンシングを用いた今後の疫学的研究モデルを提供しており、これは他の細菌種に適用できる可能性がある。

サマリー原文（英語）はこちら

監訳者コメント：

日本の MRSA の分離頻度の推移と分子疫学に関する研究。MRSA の分離率は低下したが、いわゆる CA-MRSA は増加した。経時的な増減だけでなく、薬剤感受性の推移や、MLST にも触れている。日本の MRSA の疫学について深掘りしたい人には必須の論文。

Epidemiology of and risk factors for mortality due to carbapenemase-producing organisms (CPO) in healthcare facilities

S. Zhao*, S. Kennedy, M.R. Perry, J. Wilson, M. Chase-Topping, E. Anderson, M.E.J. Woolhouse, M. Lockhart

*University of Edinburgh, UK

Journal of Hospital Infection (2021) 110, 184-193

Identification of risk factors and development of a predictive model for bloodstream infection in intensive care unit COVID-19 patients

D. Strelkova*, S. Rachina, L. Fedina, A. Vlasenko, M. Tetevina, D. Drogashevskaya, M. Chesnokova, V. Kuleshov, E. Burmistrova, I. Sychev, N. Ananicheva
*I. M. Sechenov First Moscow State Medical University, Russian Federation

Journal of Hospital Infection (2023) 139, 150-157

Diagnostic accuracy of the Abbott ID NOW SARS-CoV-2 rapid test for the triage of acute medical admissions

J.R. Barnacle*, H. Houston, I. Baltas. J. Takata, K. Kavallieros, N. Vaughan, A.K. Amin, S.A. Aali, K. Moore, P. Milner, A. Gupta Wright, L. John
*London North West University Healthcare NHS Trust, UK

Journal of Hospital Infection (2022) 123, 92-99


 

Vancomycin-resistant Enterococcus faecium: impact of ending screening and isolation in a Danish University hospital

S.G.K. Hansen*, K. Klein, A. Nymark, L. Andersen, K.O. Gradel, J. Lis-Toender, C. Oestergaard, M. Chen, R. Datcu, M.N. Skov, A. Holm, F.S. Rosenvinge
*Odense University Hospital, Denmark

Journal of Hospital Infection (2024) 146, 82-92

Diagnostic stewardship programme for urine culture: impact on antimicrobial prescription in a multi-centre cohort

A.L.H. Lee^*, E.C.M. Leung, M.K.P. Lee, R.W.M. Lai
^*Prince of Wales Hospital, Hong Kong

Journal of Hospital Infection (2021) 108, 81-89