Surveillance of multi-drug resistance phenotypes in Staphylococcus aureus in Japan and correlation with whole-genome sequence findings

Y. Hosaka*, K. Yahara, A. Clark, H. Kitagawa, J. Hisatsune, M. Sugai, K. Shibayama, J. Stelling
*National Institute of Infectious Diseases, Japan

Journal of Hospital Infection (2022) 123, 34-42

背景

黄色ブドウ球菌（Staphylococcus aureus）の抗菌薬耐性は、大きな疾病負荷をかける。表現型および遺伝子型の両方のモニタリングは、新興耐性菌株の理解と封じ込めの鍵である。

目的

黄色ブドウ球菌の新たに出現した耐性の表現型のモニタリングと、重要度の高い菌株の表現型と全ゲノムシークエンシング（WGS）の結果との相関性。

方法

2011 年から 2019 年までの、213 の参加病院の 40,000 超の分離株の抗菌薬感受性試験の結果を、院内感染対策サーベイランス（JANIS）の全国的なデータベースからエクスポートした。黄色ブドウ球菌の特徴的な多剤耐性の表現型（耐性プロファイル）の長期的・地理的な分布と有病率は、病院および県の間で検討した。さらに、懸念すべき特定の耐性プロファイルを有する菌株のゲノムシークエンス解析を実施した。

結果

メチシリン耐性黄色ブドウ球菌（MRSA）の全体の有病率は、2011 年の 40.3％から 2019 年には 35.1％に低下した。しかし、9 年間で、黄色ブドウ球菌の多数の耐性プロファイルのうち、MRSA の 型の1 つのプロファイルのみが、入院患者の頻度において 10％を超える統計学的に有意な増加を示した。この MRSA のプロファイルは、オキサシリン、エリスロマイシンおよびレボフロキサシンに耐性を示した。この表現型を有する黄色ブドウ球菌分離株の WGS の結果の解析によって、ほとんどは clonal complex 8 に属しており、すべてが市中獲得型 MRSA に特有の SCCmec IV を保有することが明らかになった。

結論

特徴的な耐性プロファイルの追跡によって、MRSA の全体的な減少への理解が深まり、新たな耐性表現型の出現を認識することにつながった。本研究では、多剤耐性表現型と相関する抗菌薬耐性に関する選択的なゲノムシークエンシングを用いた今後の疫学的研究モデルを提供しており、これは他の細菌種に適用できる可能性がある。

サマリー原文（英語）はこちら

監訳者コメント：

日本の MRSA の分離頻度の推移と分子疫学に関する研究。MRSA の分離率は低下したが、いわゆる CA-MRSA は増加した。経時的な増減だけでなく、薬剤感受性の推移や、MLST にも触れている。日本の MRSA の疫学について深掘りしたい人には必須の論文。

Surveillance of hospital-acquired infections based on electronic hospital registries

A longitudinal environmental surveillance study for SARS-CoV-2 from the emergency department of a teaching hospital in Hong Kong

L. Yung*, L.Y. Leung, K.H. Lee, S. Morrell, M.W. Fong, N.H.Y. Fung, K.L. Cheng, P. Kaewpreedee, Y. Li, B.J. Cowling, E.H.Y. Lau, D.S.C. Hui, C.A. Graham, H.-L. Yen
*The University of Hong Kong, China

Journal of Hospital Infection (2023) 138, 34-41

Establishment and application of test methodology demonstrating the functionality of air purification systems in reducing virus-loaded aerosol in indoor air

J.M.B.M. van der Vossen*, A.P. Kreikamp, V. Hatt, A.M.T. Ouwens, D.J. Brasem, M. Heerikhuisen, R.C. Montijn
*The Netherlands Organisation for Applied Scientific Research TNO, the Netherlands

Journal of Hospital Infection (2023) 135, 74-80

Plasma-activated liquid as a potential decontaminant in healthcare: assessment of antibacterial activity and use with cleaning cloths


M. Fallon*, S. Kennedy, S. Daniels, H. Humphreys
*Royal College of Surgeons in Ireland University of Medicine and Health Sciences, Ireland

Journal of Hospital Infection (2024) 145, 218-223

Genomic analysis revealed distinct transmission clusters of vancomycin-resistant Enterococcus faecium ST80 in Stockholm, Sweden

1. Fang*, I. Fröding, M. Ullberg, C.G. Giske

*Karolinska University Hospital, Sweden

Journal of Hospital Infection (2021) 107, 12-15