Potential use of Fourier-transform infrared spectroscopy as a rapid screening tool for investigating nosocomial outbreaks of ST-80 vancomycin-resistant Enterococcus faecium

R.C.W. Wong*, I.Y.Y. Cheung, C.K.C. Lai, M.T. Yuk, V.C.Y. Chow, J.S.L. Leung, N.K. Chau, L.K. Konishi, L.K. Lee, I.C.F. Ng, W.Y. Tam, J.H.C. Tong, G.K.H. Siu
*Prince of Wales Hospital, Hospital Authority, China

Journal of Hospital Infection (2025) 155, 161-169

背景

フーリエ変換赤外（FT-IR）分光法は、ゲノムを使わないスペクトルに基づく型の決定技術で、多剤耐性微生物のアウトブレイクの特徴を明らかにするのに役立つ。

目的

院内アウトブレイクからの ST-80 バンコマイシン耐性エンテロコッカス・フェシウム（Enterococcus faecium）（VREf）分離株の特徴を明らかにすることにおける FT-IR 分光法の性能を評価すること。

方法

コアゲノム一塩基多型系統発生を参照法として使って、ST-80 VREf の引き起こした院内アウトブレイクの特徴を明らかにした。疫学的に関係のある 25 の分離株のうち、22 株が 1 つのアウトブレイク・クラスターに属していたことを特定した。

結果

FT-IR 分光法を、クラスターを決定するカットオフを 0.071 として使用したところ、1 つのクラスターに、系統発生的に関係のあった 22 の分離株のうち 21 株が正しく分類された。アウトブレイク・クラスターから、系統発生的に関係のなかった分離株 3 株、関係のない ST-80 の対照株 5 株、2023 年 5 月に起こった過去のアウトブレイクからの分離株 5 株を区別するのに成功した。誤って判定された環境分離株は 1 株のみであった。

結論

これらの結果は、アウトブレイクの調査を助ける迅速スクリーニングツールとして FT-IR 分光法が使用できる可能性を支持している。注目すべきは、この研究が、同じ配列型の VREf 分離株の疫学的解析において、FT-IR 分光法の性能に焦点を当てた最初の研究であることである。

サマリー原文（英語）はこちら

監訳者コメント ：

FT-IR 分光法は新しいタイピングツールとして期待される。

Pneumocystis exhalation by infants developing Pneumocystis primary infection: putative infectious sources in hospitals and the community

L. Pougnet*, C.V. Hoffmann, R. Pougnet, F. Le Ny, L. Gaitan, P. Cros, M. Artus, S. Le Gal, G. Nevez
*Université de Bretagne Occidentale, France

Journal of Hospital Infection (2021) 113, 10-13

Genomic analysis revealed distinct transmission clusters of vancomycin-resistant Enterococcus faecium ST80 in Stockholm, Sweden

1. Fang*, I. Fröding, M. Ullberg, C.G. Giske

*Karolinska University Hospital, Sweden

Journal of Hospital Infection (2021) 107, 12-15

Ethanol and isopropanol inactivation of human coronavirus on hard surfaces

1. Meyers*, R. Kass, D. Goldenberg, J. Milici, S. Alam, R. Robison

*Pennsylvania State College of Medicine, USA

Journal of Hospital Infection (2021) 107, 45-49

Does nosocomial COVID-19 result in increased 30-day mortality? A multi-centre observational study to identify risk factors for worse outcomes in patients with COVID-19

K.S. Khan*, H. Reed-Embleton, J. Lewis, J. Saldanha, S. Mahmud

*University Hospital Hairmyres, UK

Journal of Hospital Infection (2021) 107, 91-94

Appropriateness of surgical antimicrobial prophylaxis in Japanese university hospitals

H. Morioka*, H. Ohge, M. Nagao, H. Kato, R. Kokado, K. Yamada, T. Yamada, N. Shimono, Y. Nukui, S. Yoshihara, I. Sakamaki, K. Nosaka, Y. Kubo, H. Kawamura, Y. Fujikura, T. Kitaura, M. Sunakawa, T. Yagi, on behalf of Research Group of Japan Infection Prevention and Control Conference for National and Public University Hospitals
*Nagoya University Hospital, Japan

Journal of Hospital Infection (2022) 129, 189-197