ST-80 バンコマイシン耐性エンテロコッカス・フェシウム(Enterococcus faecium)の院内アウトブレイクを調査する迅速スクリーニングツールとしてフーリエ変換赤外分光法を使用できる可能性★

2025.01.17
★

Potential use of Fourier-transform infrared spectroscopy as a rapid screening tool for investigating nosocomial outbreaks of ST-80 vancomycin-resistant Enterococcus faecium

R.C.W. Wong*, I.Y.Y. Cheung, C.K.C. Lai, M.T. Yuk, V.C.Y. Chow, J.S.L. Leung, N.K. Chau, L.K. Konishi, L.K. Lee, I.C.F. Ng, W.Y. Tam, J.H.C. Tong, G.K.H. Siu
*Prince of Wales Hospital, Hospital Authority, China

Journal of Hospital Infection (2025) 155, 161-169

背景

フーリエ変換赤外(FT-IR)分光法は、ゲノムを使わないスペクトルに基づく型の決定技術で、多剤耐性微生物のアウトブレイクの特徴を明らかにするのに役立つ。

目的

院内アウトブレイクからの ST-80 バンコマイシン耐性エンテロコッカス・フェシウム(Enterococcus faecium)(VREf)分離株の特徴を明らかにすることにおける FT-IR 分光法の性能を評価すること。

方法

コアゲノム一塩基多型系統発生を参照法として使って、ST-80 VREf の引き起こした院内アウトブレイクの特徴を明らかにした。疫学的に関係のある 25 の分離株のうち、22 株が 1 つのアウトブレイク・クラスターに属していたことを特定した。

結果

FT-IR 分光法を、クラスターを決定するカットオフを 0.071 として使用したところ、1 つのクラスターに、系統発生的に関係のあった 22 の分離株のうち 21 株が正しく分類された。アウトブレイク・クラスターから、系統発生的に関係のなかった分離株 3 株、関係のない ST-80 の対照株 5 株、2023 年 5 月に起こった過去のアウトブレイクからの分離株 5 株を区別するのに成功した。誤って判定された環境分離株は 1 株のみであった。

結論

これらの結果は、アウトブレイクの調査を助ける迅速スクリーニングツールとして FT-IR 分光法が使用できる可能性を支持している。注目すべきは、この研究が、同じ配列型の VREf 分離株の疫学的解析において、FT-IR 分光法の性能に焦点を当てた最初の研究であることである。

サマリー原文(英語)はこちら

監訳者コメント :

FT-IR 分光法は新しいタイピングツールとして期待される。

同カテゴリの記事

2026.06.17
★
Candida parapsilosis dominates the surface-colonizing yeast community in the hospital environment
as revealed by a combined culture and environmental DNA approach

L. García-Gutiérrez*, A.C. Ruiz-Gaitán, M. Ruiz, S. Hernández Egido, P.M. Martin-Sanchez
*Instituto de Recursos Naturales y Agrobiología de Sevilla (IRNAS), Consejo Superior de
Investigaciones Científicas (CSIC), Spain

Journal of Hospital Infection (2026) 172, 110-114
2022.09.05
★
Prevalence of alcohol-tolerant and antibiotic-resistant bacterial pathogens on public hand sanitizer dispensers

Y.W.S. Yeung*, Y. Ma, S.Y. Liu, W.H. Pun, S.L. Chua
*The Hong Kong Polytechnic University, China

Journal of Hospital Infection (2022) 127, 26-33

2023.01.06
★
Compliance with a novel hand hygiene protocol tailored to non-sterile healthcare workers in the operating theatre

M.D. van Dijk*, C.M. Waltmans-den Breejen, J.M.J.J. Vermeeren, S. van den Berg, E.F. van Beeck, M.C. Vos, on behalf of the Cooperating Rijnmond Hospitals
*Erasmus MC University Medical Centre Rotterdam, the Netherlands

Journal of Hospital Infection (2023) 131, 173-180


2026.08.28
★
Eliminating Staphylococcus aureus colonisation prior to surgery through screening and decolonisation measures in the outpatient setting: how well does outpatient decolonisation work in practice from the patients’ perspective?

A. Bauer*, P. Martus, H. Eberhardt, E. Mayer, B. Brüggenjürgen, S. Joos, M. Grünewald, H. Sturm, in the name of the STAUfrei Consortium
*University Hospital Tüingen, Germany

Journal of Hospital Infection (2026) 174, 451-458
2026.05.16
★
Machine learning—based diagnostic model combined with Chinese natural language processing for surgical-site infections: development and validation

J. Shan*, X.Y. Bao, M. Jin, B. Wang, Y.B. Wang, Y. Wang, M. Lv, W. Huai, Y.C. Jin, Y.X. Jin, Z.X. Zhang, Y.L. Cao
*Beijing Jishuitan Hospital, Capital Medical University, China

Journal of Hospital Infection (2026) 171, 69-78