Molecular and epidemiological characterisation of clinical isolates of carbapenem-resistant Acinetobacter baumannii from public and private sector intensive care units in Karachi, Pakistan

S. Irfan^*, J.F. Turton, J. Mehraj, S.Z. Siddiqui, S. Haider, A. Zafar, B. Memon, O. Afzal, R. Hasan
^*Aga Khan University Hospital, Pakistan
Journal of Hospital Infection (2011) 78, 143-148
本研究の目的は、パキスタン・カラチの 2 つの集中治療室（ICU）からのカルバペネム耐性アシネトバクター・バウマニー（Acinetobacter baumannii）の院内分離株の分子的・疫学的特性を明らかにすることである。2007 年 11 月から 2008 年 8 月に、私立の 3 次病院の成人 ICU と公立病院の成人 ICU で横断研究を実施した。臨床検体中のカルバペネム耐性 A. baumannii 分離株から同一患者の重複株を除外し、カルバペネマーゼ遺伝子およびクラス 1 インテグラーゼ遺伝子について調べた。遺伝子配列に基づいて、マルチプレックス PCR、パルスフィールド・ゲル電気泳動（PFGE）、および variable number tandem repeat（VNTR）解析により分離株のタイピングを行った。患者合計 50 例（私立 ICU 33 例、公立 ICU 17 例）を登録した。両 ICU の患者の間には、平均年齢、併存疾患、中心静脈圧ラインの有無、尿路カテーテル、および平均入院期間に統計学的な有意差が認められた。獲得性のオキサシリナーゼ遺伝子 bla_OxA-23-like が分離株 50 株中 47 株で検出された。クラス 1 インテグラーゼ遺伝子は分離株の 50％（50 株中 25 株）で検出された。大半の分離株は European clone I および European clones II に属していた。PFGE タイピングにより分離株は 8 つのクラスターに分類され、このうち 3 つは両病院から検出された。PFGE で分類された各クラスター内の分離株の大部分は、VNTR プロファイルが同一または高度に類似しており、密接な疫学的関連が示唆された。両 ICU は、リスク因子や感染制御の方針・実践が異なるにもかかわらず、カルバペネム耐性 A. baumannii 分離株のクローン性は高度に類似していた。
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Resolving a neonatal intensive care unit outbreak of meticillin-resistant Staphylococcus aureus to the single-nucleotide variant level using Oxford Nanopore simplex reads and HERRO error correction

M. Bloomfield*, S. Bakker, M. Burton, M.L. Castro, K. Dyet, A. Eustace, S. Hutton, D. Macartney-Coxson, W. Taylor, R.T. White
*Wellington Regional Hospital, New Zealand

Journal of Hospital Infection (2025) 163, 72-77

Characterisation of vancomycin-resistant enterococci from hospitalised patients at a tertiary centre over a seven-year period

Incidence and characteristics of nosocomial influenza in a country with low vaccine coverage
D. Luque-Paz^*, C. Pronier, B. Bayeh, S. Jouneau, C. Grolhier , A. Le Bot, F. Bénézit, V. Thibault, P. Tattevin
^*Pontchaillou University Hospital, France
Journal of Hospital Infection (2020) 105, 619-624

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