病院アウトブレイク時のアシネトバクター・バウマニー（Acinetobacter baumannii）分離株の疫学的分析のための全ゲノム高性能シークエンス法
High-throughput whole-genome sequencing to dissect the epidemiology of Acinetobacter baumannii isolates from a hospital outbreak
T. Lewis*, N.J. Loman, L. Bingle, P. Jumaa, G.M. Weinstock, D. Mortiboy, M.J. Pallen
*University Hospitals Birmingham NHS Foundation Trust, UK
Journal of Hospital Infection (2010) 75, 37窶・1
軍人と民間人の患者を同一施設内でケアすることにより、軍人負傷者から民間人への多剤耐性アシネトバクター・バウマニー（Acinetobacter baumannii）の伝播が生じる。現在の分子タイピング技術は、A. baumannii分離株間の関連性を示すのに有用であるが、小規模なアウトブレイク時の近縁分離株間の相違を解析できないため、伝播の連鎖が不明となることが多い。最近、バーミンガムで発生した病院アウトブレイクでは、6例の患者に標準的手法では識別不能な多剤耐性A. baumannii分離株の保菌がみられた。全ゲノムシークエンス法を用いてこれらの分離株の一塩基多型を判定することによって、本アウトブレイクの伝播に関する複数の疫学的仮説を検証することができた。
サマリー原文（英語）はこちら
監訳者コメント：
Single nucleotide polymorphisms（SNPs）により識別解析を行った論文である。シークエンサーは気軽に使用できる器材ではないので、ハードウエア的な利便性が課題だろう。
同カテゴリの記事
Risk factors for KPC-producing Enterobacteriaceae acquisition and infection in a healthcare setting with possible local transmission: a case–control study
FUrTIHF: French urinary tract infections in healthcare facilities — five-year historic cohort (2014 — 2018) S. de Lafforest*, A. Magnier, M. Valleé, E. Bey, C. Le Goux, F. Saint, A. Therby, J.R. Zahar, A. Sotto, F. Bruyere, L. Grammatico-Guillon *EpiDcliC, unité de santé publique, France Journal of Hospital Infection (2021) 116, 29-36
Trends in rates of incidence, fatality and antimicrobial resistance among isolates of Pseudomonas spp. causing bloodstream infections in England between 2009 and 2018: results from a national voluntary surveillance scheme S.M. Gerver*, O. Nsonwu, S. Thelwall, C.S. Brown, R. Hope *UK Health Security Agency, UK Journal of Hospital Infection (2022) 120, 73-80
Weak organic acid synergy towards the prevention of catheter blockages
J. Burns*, C.P. McCoy, N.J. Irwin
*Queen’s University Belfast, UK
Journal of Hospital Infection (2021) 111, 69-77
Mapping national surveillance of surgical site infections in England: needs and priorities